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应用1: 

使用水凝胶珠实现高包封率(击败泊松包封统计)

通过特殊设计的微流控通道和与drop-seq芯片相同的微流控芯片原理图,我们使用水凝胶珠在我们的单细胞分析研发平台上展示了90%的水凝胶包封率(如下图所示)。

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图.  柔性水凝胶微流控芯片原理图 beans和细胞分离捕获
使用定制设计的 PDMS 微流体芯片通过液滴封装细胞和水凝胶豆的演示视频。该视频是使用 PreciGenome 单细胞分析系统以 1000 FPS 捕获的。  
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该图显示 90%的液滴含有单个水凝胶珠。 通过附加官能团,水凝胶珠具有多种应用,例如细胞培养、药物递送研究等。结合具有不同附件的单分散水凝胶珠和微流控液滴技术,实现了单细胞和单珠的高包封率,从而形成许多独立的反应室。研究人员可以研究不同环境下的单个细胞行为。通过在水凝胶珠上添加条形码,可以实现单细胞 RNA 测序。研究人员可以研究罕见的癌细胞突变、对新药的反应、CRISPR筛选等。利用这个平台,还可以实现细胞分离和分选。

Application Note

基于液滴的DNA/RNA测序 单细胞分析研发应用系统

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PreciGenome 提供了一个自动化的、用于单细胞研究的基于微流体液滴的平台封装细胞和条形码珠子。

 

该系统足够灵活,允许研究人员进行类似 drop-seq 的实验(使用聚苯乙烯珠上的 macosko 测序仪作为条形码,泊松封装统计)或类似 in-drop 的实验(使用水凝胶珠作为条形码载体;水凝胶珠的封装率可以高达90%;单个细胞和一个珠子在单个液滴中的包封率可高达9%)。

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应用2: 

使用聚苯乙烯珠实现泊松封装统计

我们使用两种类型(不同光学特性)的 10um 聚苯乙烯珠来模拟 drop-seq 细胞和条形码珠捕获过程。如下图所示,将珠子 1 和珠子 2 加载到两个孔中,分别模拟带条形码的聚苯乙烯珠子和细胞。在第三口井中,装载油以帮助产生液滴。使用我们的平台,可以生成大小均匀的稳定液滴。按照泊松统计,珠子 1 和珠子 2 被封装在液滴中。为了尽量减少封装在一个液滴中的两个相同的珠子,需要稀释珠子,使大约 10% 的液滴包含一种类型的珠子。因此,1% 的液滴包含单个珠子 1 和珠子 2,如下图所示。

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图.  drop-seq bead 1的微流控芯片原理图(如barcoded_cc781905-5cde-3194-bb3b-136bad5cf58d)在油中
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形象的集具有不同珠子的液滴(粉红色的珠子 1,黄色的珠子 2,或没有珠子)。粉红色矩形内的液滴包含单个珠子 1 和 2。
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